 | Stellen Sie sicher, daß Sie einen gefilterten Datensatz geladen haben. Sie können auch eine andere Segmentierung als Basis verwenden. Klicken Sie in letzterem Fall hier, um die bisherigen Markierungen zu löschen. |
| Stellen Sie Helligkeit und Kontrast so ein, daß auch dunkle Bereiche grau erscheinen, damit Sie die Schwellwertmarkierung gut erkennen können. Center=30, Width=40 funktioniert meist gut. | |
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Startschicht wählenVerwenden Sie im Fenster Planes_XY, die linke Maustaste oder die Tasten Pos1 und Ende, um die erste Schicht zu wählen. |
| Gehen Sie dazu zuerst bis ganz nach außen zum rechten oder linken Ohr und dann langsam zurück, bis Sie die erste Schicht sehen, auf der Cortexgewebe klar zu erkennen ist. | |
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Farbe wählenWählen Sie im Fenster NeuroTuxColorize, die Farbe rot (4) aus. Zum Korrigieren können Sie dort die Farbe 0 auswählen. |
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Schichten markierenErste SchichtUmreißen Sie nun das Cortexgewebe mit einer geschlossenen Linie, indem Sie die linke Strg-Taste festhalten und dann mit der linken Maustaste zeichnen. |
 | Anschließend zeigen Sie mit dem Mauszeiger in das umrissene Gebiet und drücken bei festgehaltener linker Strg-Taste die mittlere Maustaste. |
Umreißen Sie jeweils erneut Cortex und ggf. Cerebellum, indem Sie innen am Schädelknochen entlang mit der linken Strg und der linken Maustaste zeichnen. Sie müssen diese Zwischensichten nicht ausfüllen (mittlere Maustaste nicht nötig).
Dabei sollten Sie für die ersten 4 weiteren Schichten einen Abstand von 5 Ebenen verwenden (5xPos1 bzw. Ende drücken).
Für die weiteren Schichten können Sie einen Abstand von 10 Ebenen verwenden.
In der Nähe des anderen Endes verwenden Sie wieder einen Abstand von 5 Ebenen, um die Genauigkeit zu verbessern. Fügen Sie ggf. eine weitere Schicht hinzu, die gerade die letzte noch erkennbare Schicht umreißt.
Füllen Sie diese letzte Schicht wieder mit linker Strg-Taste und mittlerer Maustaste.
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Wählen Sie nun das Fenster Planes_XZ und
gehen Sie die axialen Schichten langsam von unten her durch. Achten Sie dabei darauf, ob die Umrisse geschlossen sind. |
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Sobald Sie nicht geschlossene Bereiche (s. links) finden, markieren Sie
diese erneut mit der linken Strg- und
der linken Maustaste. |
| Das muß nicht auf jeder Ebene geschehen. Zeichnen Sie einfach alle ca. 10 Ebenen eine Strich, der die Lücke schließt, wobei Sie ein wenig über den noch vorhandenen Rand hinwegzeichnen sollten, um in den Nachbarebenen eine gute Füllung zu erreichen. | |
 | Zeigen Sie nun mit der Maus in einem der Planes_-Fenster auf einen Punkt innerhalb der eben geschaffenen Hülle und drücken Sie die Taste F9. |
Die Hülle muß sich komplett füllen, darf aber nicht auslaufen. Sollte das doch geschehen, können Sie mit der Taste F12 die Füllung zurücknehmen. Überprüfen Sie in diesem Fall die obigen Schritte - ggf. auf anderen 2D-Ansichten.
| Voxelzahl: | --- |
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