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Voxren Nutzerhandbuch
Layer
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Wir laden zunächst ein geglättetes Grauwertvolumen und starten ein
Autoseg-Script mit niedriger Schwelle, z.B. autoseg150 aus dem Verzeichnis
"voxren/colon".
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Nach der Autosegmentierung haben wir Haut, Liege, Darm und Teile der Lunge
alle in derselben Farbe markiert. Das ist nicht sehr übersichtlich.
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Wir benutzen nun die Umfärben-Funktion mit Hilfe des Color Optionsmenüs, um
die Haut und die Liege passend einzufärben. Dazu wählen wir die Farbklasse
"Haut (35)".
Halten Sie nun die Taste Strg gedrückt und klicken Sie mit der
rechten Maustaste auf einen Punkt der Hautoberfläche.
Analog wird mit der Liege verfahren.
Dabei entfernt man ggf. durch Zeigen auf ein Objekt und Drücken der Taste
'h' zur Zeit nicht benötigte Layer aus der Anzeige, um die Übersicht zu
verbessern. Hohlobjekte, wie z.B. die Liege besitzen übrigens meist
zwei Oberflächen (Innen- und Außenseite) und müssen entsprechend
zweimal umgefärbt werden.
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Entfernt man die bereits kategorisierten Layer Haut und Liege (mit 'h'),
bleiben drei Pixelklassen übrig: Der Darm, Teile der Lunge und etwas
"Gekrümel".
Da nur der Darm für uns interessant ist, entscheiden wir uns für den
einfachen Weg, die Reste loszuwerden:
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Wir färben zunächst den Darm mit einem Strg-Rechtsklick um auf z.B.
Layerklasse Darmhell (36). Dann bleibt der Rest übrig in Klasse 32.
Diese färben wir zu Demonstrationszwecken mit
dem Kommando "remark 32 33" Funktion um auf Klasse 33 (rot).
Damit haben wir ein schön segmentiertes Volumen erhalten, aus dem man je
nach gewünschter Untersuchung die entsprechenden Anteile extrahieren kann.
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