Dateiformate

Schichtstapel

CT-Daten liegen meist in Form von DICOM-Schichtstapeln vor.

Erforderliche Namenskonvention

Damit ColoTux solche Stapel verarbeiten kann, müssen die Dateien aufsteigend nummeriert sein und führende Nullen enthalten.

Empfohlene Importwerkzeuge

Wir empfehlen, die Daten über die PACS/Offis Option oder die Load DICOM CD Funktion zu importieren. Beide Programme erzeugen automatisch eine geeignete Benennung.

Konversion von Fremdstapeln

Haben Sie DICOM-Stapel auf anderem Weg auf den Rechner kopiert, so können Sie versuchen, diese Daten mit dem Kommando eccet_convert_dicomstack in das nötige Format zu bringen. Begeben Sie sich dazu in das Verzeichnis mit dem (noch anders benannten) Schichtstapel und rufen Sie von der Kommandozeile aus eccet_convert_dicomstack auf.

Laden eines Stapels

Wählen Sie, wenn das Verzeichnis und darin die erste Datei des Stapels und klicken Sie auf "Open".

Laden von Teilstapeln

Wenn Sie nicht die erste Datei wählen, werden die Daten erst ab der gewählten Schicht geladen. Das kann sinnvoll sein, wenn der Scan sehr weit oben begonnen wurde und die obersten Schichten gar nicht benötigt werden.

Laden von vorverarbeiteten Daten (.3d32)

Statt eines Schichtstapels können Sie auch bereits vorverarbeitete Daten verwenden. Sie erkennen diese an der Dateiendung .3d32.
Falls sie vorverarbeitete Daten verwenden, können Sie den späteren Vorverarbeitungsschritt natürlich überspringen.

Vorverarbeitete Daten liegen in einer einzelnen großen Datei vor - es ist kein ganzer Stapel von Schichten notwendig.

Kompression (.gz/.bz2)

ECCET ist in der Lage, Dateien transparent zu komprimieren und zu dekomprimieren. Dazu unterstützt es die Programme GZIP und BZIP2.
ZIP ist leider nicht geeignet, einzelne Dateien zu komprimieren, da es ein Containerformat ist. Sie können bzip2- oder gzip-Dateien aber mit WinZIP unter Windows problemlos öffnen, falls Sie das möchten.

Dateien mit der Endung .gz sind mit GZIP, Dateien mit der Endung .bz2 mit BZIP2 komprimiert. BZIP2 komprimiert besser, benötigt aber eine deutlich längere Zeit dafür.

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